Em 2006, em seu segundo ano, o Atlético disputou a Copa Libertadores da América de 2006 derrotando o Corinthians na ♣ final.
Em 2011, disputou o Mundial de Clubes pelo Brasil no Chile.
Em 2013, voltou a ser vice-campeão brasileiro da Copa Libertadores ♣ da América de 2013 e do Campeonato Paulista de 2013.
Em 2015 disputou a Copa América do Sul, onde derrotou o ♣ Botafogo na final por 2 a 1, no Estádio de Laranjeiras.
Nesse mesmo ano, começou a